More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4448 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4448  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 326 aa  627  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 340 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  36.51 
 
 		 307 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  35.28 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  36.07 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5170  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.268842 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7057  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3957  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0264307 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6295  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3951  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.254801 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  36.54 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  31.09 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  30.03 
 
 		 284 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  29.7 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  33.45 
 
 		 318 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 348 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 348 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  32.73 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.48 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  27.48 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5827  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  27.48 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  30.07 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 284 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 334 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 		 349 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  32.84 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 284 aa  112  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  30.72 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  26.82 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  30.57 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  33.1 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  30.55 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  33.84 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  29.28 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  33.46 
 
 		 334 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.63 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 305 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  29.33 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  29.26 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  33.99 
 
 		 297 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6701  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 279 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  27.85 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  31.71 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  30.83 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  30.15 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  30.15 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 305 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  28.86 
 
 		 303 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>