More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5827 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5827  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 356 aa  715    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1536  AraC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6332  AraC family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6509  AraC family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6743  AraC family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645545  normal  0.349811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  44.75 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 306 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2927  putative transcriptional regulator  43.69 
 
 		 301 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34450  AraC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 301 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000710752  normal  0.295536 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  30.66 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 344 aa  122  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  34.91 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  32.36 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  30.96 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3951  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 317 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.254801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  32.62 
 
 		 297 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  29.56 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  31.95 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  30.23 
 
 		 345 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 315 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6295  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  32.62 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4448  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  30.9 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  31.16 
 
 		 324 aa  102  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  29.06 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5170  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.268842 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  28.77 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  29.82 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  22.85 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  30.32 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  28.99 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 273 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 325 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 334 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3957  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 322 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0264307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 349 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  29.21 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  21.17 
 
 		 311 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  28.67 
 
 		 329 aa  96.3  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 329 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 304 aa  95.9  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7057  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 333 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  31.37 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  29.39 
 
 		 303 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  30.67 
 
 		 302 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  22.85 
 
 		 330 aa  93.6  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 297 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 315 aa  93.6  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 		 314 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 297 aa  92.8  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2813  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 214 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 315 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 315 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  31.97 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  36.24 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 325 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 340 aa  90.5  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 320 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 320 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 317 aa  89.4  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>