More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2564 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  94.27 
 
 
349 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
349 aa  704    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  94.56 
 
 
349 aa  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  89.37 
 
 
344 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  89.08 
 
 
344 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  87.65 
 
 
320 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  87.65 
 
 
320 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  86.15 
 
 
333 aa  547  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  60.58 
 
 
318 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  58.65 
 
 
318 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  48.73 
 
 
328 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  48.33 
 
 
340 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  45.19 
 
 
329 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  37.54 
 
 
329 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  37.12 
 
 
329 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  37.9 
 
 
327 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  32.17 
 
 
327 aa  175  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  34.7 
 
 
312 aa  165  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  31.85 
 
 
307 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  33.54 
 
 
335 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 
325 aa  149  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 
333 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  32.82 
 
 
356 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  35.76 
 
 
359 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  32.3 
 
 
324 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 
320 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 
330 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 
214 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  30.55 
 
 
337 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 
325 aa  133  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  33.76 
 
 
319 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  30.82 
 
 
322 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 
313 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 
318 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 
331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  31.83 
 
 
317 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  31.56 
 
 
311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 
329 aa  126  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
301 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 
311 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 
315 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 
311 aa  124  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  32.51 
 
 
295 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 
334 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
312 aa  123  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 
334 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  28.61 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4732  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  32.33 
 
 
332 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 
308 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  30.41 
 
 
345 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  29.81 
 
 
301 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6188  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 
304 aa  113  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  30.84 
 
 
324 aa  112  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 
306 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 
323 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  29.54 
 
 
306 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 
308 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 
321 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  29.49 
 
 
301 aa  109  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 
327 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 
327 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 
313 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 
348 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 
303 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  32.4 
 
 
234 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.41 
 
 
307 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1911  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 
369 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2035  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 
243 aa  106  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 
311 aa  106  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  27.81 
 
 
349 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  26.22 
 
 
322 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
309 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  31.12 
 
 
327 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
348 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
348 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 
310 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  28.75 
 
 
333 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  32.4 
 
 
304 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.16 
 
 
338 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  32.05 
 
 
313 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 
305 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
301 aa  102  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  29.25 
 
 
318 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
348 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>