More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6295 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6295  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5170  AraC family transcriptional regulator  58.1 
 
 		 318 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.268842 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3957  AraC family transcriptional regulator  56.33 
 
 		 322 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0264307 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3951  AraC family transcriptional regulator  53.94 
 
 		 317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.254801 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7057  AraC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 340 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  35.78 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 316 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  35.12 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 316 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 315 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 322 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  33.97 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  33.97 
 
 		 303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4448  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  30.18 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  29.49 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.39 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  27.39 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  28.39 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  27.39 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  27.74 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  27.07 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 284 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5827  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 356 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  31.43 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  25.62 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 311 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 348 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  28.38 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 297 aa  99.4  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  28.78 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  27.69 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  27.65 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  27.04 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  29.62 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 303 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.25 
 
 		 307 aa  96.3  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  29.05 
 
 		 318 aa  96.3  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 		 305 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  28.16 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  29.34 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6701  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1536  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 359 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 330 aa  91.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  26.73 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  28.49 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  27.76 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1236  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000472369  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3390  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 279 aa  90.9  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  28.53 
 
 		 327 aa  90.1  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 277 aa  90.1  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  27.81 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  30.42 
 
 		 333 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 285 aa  89.7  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 285 aa  89.4  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2344  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 247 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  32.03 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 199 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3375  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>