More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6114 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 322 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  73.58 
 
 		 316 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  38.85 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  37.15 
 
 		 323 aa  188  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  37.3 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  36.56 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  31.75 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3951  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.254801 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 284 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 284 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 284 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  30.48 
 
 		 284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5170  AraC family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.268842 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3957  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0264307 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  37.46 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.52 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  29.52 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 284 aa  156  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6295  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 327 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 340 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  29.21 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 315 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 315 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  35.38 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  33.87 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 311 aa  135  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7057  AraC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  35.25 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  31.29 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  29.34 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 214 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  32.59 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 349 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4448  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 326 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  34.82 
 
 		 356 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  32.49 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  32.47 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  32.27 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  29.38 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  32.47 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  28.96 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  34.27 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  31.95 
 
 		 329 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 306 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  33.45 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 303 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  29.11 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  30.79 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  32.42 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  28.93 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  28.74 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  23.82 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  30.37 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  29.02 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  29.84 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 308 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 308 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>