More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6608 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 330 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 312 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  55.17 
 
 		 335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  51.77 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  51.9 
 
 		 313 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  49.85 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  62.98 
 
 		 214 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  44.79 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  46.67 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  48.72 
 
 		 319 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  35.83 
 
 		 327 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  36.39 
 
 		 301 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  34.59 
 
 		 327 aa  175  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  35.39 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  39.55 
 
 		 321 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  40.26 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  33.87 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  33.87 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 310 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 309 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  35.94 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  32.31 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  33.85 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 349 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  34.14 
 
 		 349 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  36.28 
 
 		 297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  31.61 
 
 		 329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 344 aa  151  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  34.23 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  34.06 
 
 		 331 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  31.09 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  36.39 
 
 		 324 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 325 aa  146  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  34.91 
 
 		 333 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  34.67 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 327 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 319 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  35.81 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  32.82 
 
 		 314 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  37.02 
 
 		 345 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  28.85 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  34.63 
 
 		 297 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  35.59 
 
 		 359 aa  139  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 332 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  29.68 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.11 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.75 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 320 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 348 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 325 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 325 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  37.54 
 
 		 325 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  35.26 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  34.26 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40.48 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 311 aa  133  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>