More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1711 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 307 aa  619  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  39.14 
 
 		 321 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  37.85 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  35.13 
 
 		 319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  35.31 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  35.88 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  36.1 
 
 		 333 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  33.76 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  35.69 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8401  transcriptional regulator, AraC family  34.58 
 
 		 330 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  35.65 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  33.21 
 
 		 305 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3544  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 318 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0903  transcriptional regulator, AraC family  35.37 
 
 		 328 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  34.48 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6188  transcriptional regulator, AraC family  34.85 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  32.15 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.33 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  33.23 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  31.35 
 
 		 327 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  34.22 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  32.9 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  34.25 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  35.22 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  34.77 
 
 		 329 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  34.2 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 327 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  35.92 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 325 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  35.02 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.54 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  33.45 
 
 		 304 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 214 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.66 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  32.23 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 297 aa  126  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  30.26 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  32.27 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1395  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 324 aa  122  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 310 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  30.52 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 316 aa  122  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  28.88 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  31.02 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 199 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  31.74 
 
 		 359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  29.58 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  31.17 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  30.36 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>