More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4554 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 351 aa  686    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  55.59 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6188  transcriptional regulator, AraC family  44.88 
 
 		 314 aa  238  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  43.11 
 
 		 323 aa  225  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 313 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 313 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 313 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  39.88 
 
 		 319 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  40.48 
 
 		 332 aa  192  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  38.07 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0903  transcriptional regulator, AraC family  37.35 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8401  transcriptional regulator, AraC family  37.2 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0852  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.14 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2404  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.36 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  35.17 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  28.96 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  30.47 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3544  transcriptional regulator, AraC family  33.93 
 
 		 318 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  32.65 
 
 		 307 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  32.46 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 295 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 330 aa  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 214 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  32.84 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.41 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 342 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  27.16 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 325 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  28.65 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  29.33 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  29.61 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 199 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  35.95 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  28.99 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 344 aa  106  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 317 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  39.43 
 
 		 325 aa  106  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 337 aa  105  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  28.37 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  44.68 
 
 		 329 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  29.43 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 239 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  36.32 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  31.04 
 
 		 319 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 325 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 305 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 325 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  37.31 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  39.35 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1540  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000047582  hitchhiker  0.00155056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  39.55 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  29.05 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 314 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  28.49 
 
 		 320 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  28.49 
 
 		 320 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0851  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 305 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  45.05 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  37.67 
 
 		 328 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  36.5 
 
 		 301 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 305 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 330 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 310 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  36.5 
 
 		 301 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  28.36 
 
 		 345 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  28.37 
 
 		 333 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 306 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  35.77 
 
 		 301 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  42.03 
 
 		 309 aa  96.3  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  26.44 
 
 		 301 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>