More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4424 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4424  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 337 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.353998  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  73.83 
 
 		 327 aa  415  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  41.16 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  37.22 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  32.72 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 333 aa  123  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  33.85 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  31.7 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  35.31 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  45.18 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 214 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  32.57 
 
 		 301 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 342 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  32.37 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 348 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  30.49 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  35.86 
 
 		 321 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 311 aa  110  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.73 
 
 		 323 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  31.27 
 
 		 335 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  52.07 
 
 		 315 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  34.08 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8401  transcriptional regulator, AraC family  35.02 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3544  transcriptional regulator, AraC family  33.78 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  30.89 
 
 		 324 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 333 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  33.55 
 
 		 311 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  47.68 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 310 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  27.74 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 327 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  32.24 
 
 		 331 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  28.2 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  30.31 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.49 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 199 aa  99.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 344 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0903  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 328 aa  99.4  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  32.78 
 
 		 308 aa  99.4  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 		 318 aa  99.4  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  26.73 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  27.63 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 306 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  29.8 
 
 		 314 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 313 aa  95.9  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  30.92 
 
 		 319 aa  95.9  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 312 aa  95.9  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  30.55 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  25.08 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 333 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 322 aa  94  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  28.39 
 
 		 331 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 322 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 320 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 297 aa  92.4  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 297 aa  92.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>