More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4130 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4130  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 265 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47910  putative transcriptional regulator  98.21 
 
 		 224 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00926121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1839  AraC family transcriptional regulator  62.92 
 
 		 281 aa  317  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4602  AraC family transcriptional regulator  59.35 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0287774  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1287  AraC family transcriptional regulator  59.35 
 
 		 260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4131  AraC family transcriptional regulator  61.44 
 
 		 260 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2310  AraC family transcriptional regulator  59.75 
 
 		 256 aa  298  9e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0878  AraC family transcriptional regulator  57.49 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776666  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4563  transcriptional regulator, AraC family  57.38 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3060  AraC family transcriptional regulator  55.08 
 
 		 264 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4961  AraC family transcriptional regulator  55.08 
 
 		 264 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0263791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5307  AraC family transcriptional regulator  55.08 
 
 		 264 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4671  AraC family transcriptional regulator  56.96 
 
 		 279 aa  288  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5196  AraC family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 264 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82206  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4668  AraC family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 264 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.622787 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1415  AraC family transcriptional regulator  57.68 
 
 		 290 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1891  AraC family transcriptional regulator  57.68 
 
 		 294 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0885  AraC family transcriptional regulator  57.68 
 
 		 290 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0341  AraC family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.729431 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0574  AraC family transcriptional regulator  57.68 
 
 		 290 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.389496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0477  AraC family transcriptional regulator  57.68 
 
 		 290 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.555067  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2199  AraC family transcriptional regulator  57.68 
 
 		 290 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2063  AraC family transcriptional regulator  57.26 
 
 		 311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3416  AraC family transcriptional regulator  57.26 
 
 		 279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0904858  normal  0.667905 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2498  AraC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 245 aa  234  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  49.78 
 
 		 242 aa  222  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  44.59 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3003  transcriptional regulator, AraC family  44.59 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723875 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  37.92 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2851  transcriptional regulator with PAS/PAC sensors, AraC family  41.36 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.595855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1157  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  31.08 
 
 		 255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  35.14 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0773  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1667  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 513 aa  72.4  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 1254 aa  72.4  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1252  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385086 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1820  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  36.28 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  36.61 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  34.51 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  31.31 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  35.4 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2069  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020463  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1906  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166677  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0213  transcriptional regulator, AraC family protein  35.29 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887507 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2340  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581264  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0694  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  35.79 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.38 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3072  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.675846  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  32.11 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3270  AraC-like transcriptional regulator  38.89 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2425  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.989434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  24.76 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  39.09 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0731  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.617247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1174  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0565  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 327 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1799  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000057295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  33.64 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>