More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0574 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0574  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.389496  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1415  AraC family transcriptional regulator  99.66 
 
 		 290 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0885  AraC family transcriptional regulator  99.66 
 
 		 290 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0477  AraC family transcriptional regulator  99.66 
 
 		 290 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.555067  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2199  AraC family transcriptional regulator  99.66 
 
 		 290 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1891  AraC family transcriptional regulator  98.3 
 
 		 294 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2063  AraC family transcriptional regulator  84.57 
 
 		 311 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4961  AraC family transcriptional regulator  74.39 
 
 		 264 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0263791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3060  AraC family transcriptional regulator  74.39 
 
 		 264 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5307  AraC family transcriptional regulator  74.39 
 
 		 264 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0341  AraC family transcriptional regulator  73.36 
 
 		 264 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.729431 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3416  AraC family transcriptional regulator  81.97 
 
 		 279 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0904858  normal  0.667905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5196  AraC family transcriptional regulator  77.99 
 
 		 264 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82206  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4668  AraC family transcriptional regulator  77.99 
 
 		 264 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.622787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0878  AraC family transcriptional regulator  74.6 
 
 		 256 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776666  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4671  AraC family transcriptional regulator  76.37 
 
 		 279 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4563  transcriptional regulator, AraC family  74.9 
 
 		 255 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4130  putative transcriptional regulator  57.68 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47910  putative transcriptional regulator  58.04 
 
 		 224 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00926121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2310  AraC family transcriptional regulator  55.65 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1839  AraC family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 281 aa  262  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4602  AraC family transcriptional regulator  54.31 
 
 		 279 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0287774  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1287  AraC family transcriptional regulator  54.31 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4131  AraC family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 260 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2498  AraC family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 245 aa  218  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  46.19 
 
 		 242 aa  215  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  44.64 
 
 		 241 aa  209  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3003  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 240 aa  196  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723875 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  34.78 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 245 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1157  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2851  transcriptional regulator with PAS/PAC sensors, AraC family  34.25 
 
 		 256 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.595855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  27.04 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  40.21 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5726  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435974  normal  0.869518 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 274 aa  72  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6479  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252403  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  36.29 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6918  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1914  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 516 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  34.68 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1452  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6376  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7040  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165812  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  39.76 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0432  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3908  AraC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761684  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4119  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3895  helix-turn-helix domain-containing protein  33.68 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2201  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.608113  decreased coverage  0.002281 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 151 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2008  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232037  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  34.95 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4538  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 517 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  37.36 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  41.3 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 986 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0587  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0551242  normal  0.259692 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0530  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285537 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  41.98 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0074  transcriptional regulator, AraC family protein  35.92 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 151 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6879  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0489024  normal  0.393248 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  36.63 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 154 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  34.34 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1714  AraC-type transcriptional regulator-like protein  35.92 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00197834  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 143 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 148 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 143 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>