More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3415 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  51.32 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 269 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  50.75 
 
 		 268 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  50.75 
 
 		 275 aa  241  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  51.72 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0007  AraC family transcriptional regulator  50.19 
 
 		 272 aa  234  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0040  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451948  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 275 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 264 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 264 aa  211  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4288  transcriptional regulator, AraC family  47.47 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.170174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0617  AraC family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 264 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 264 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 264 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  50 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0901  AraC family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 264 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2371  AraC family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 263 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0360277  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0321  transcriptional regulator, AraC family  43.25 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2007  AraC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 266 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2143  AraC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1126  AraC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0931  AraC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.846737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1568  AraC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0287073  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0228  AraC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1986  AraC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  41.45 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 278 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  34.1 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  36.02 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  37.55 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 312 aa  135  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  32.18 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  33.46 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  37.16 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  34.66 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  32.95 
 
 		 278 aa  128  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  33.07 
 
 		 278 aa  128  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 278 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  30.22 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  39.08 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 278 aa  125  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 279 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  28.34 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 280 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5781  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273852 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  27.57 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  34.77 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  36.33 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2911  transcriptional regulator, AraC family  33.06 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1551  transcriptional regulator, AraC family  30.04 
 
 		 281 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 306 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 306 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 273 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2317  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 274 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  35.22 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  32.52 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>