More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01433 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  501  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  56.64 
 
 		 241 aa  278  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3003  transcriptional regulator, AraC family  55.56 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4563  transcriptional regulator, AraC family  48.66 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4671  AraC family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0878  AraC family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 256 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776666  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0341  AraC family transcriptional regulator  49.1 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.729431 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3416  AraC family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0904858  normal  0.667905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5196  AraC family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 264 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82206  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4961  AraC family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 264 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0263791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3060  AraC family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 264 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4668  AraC family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 264 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.622787 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5307  AraC family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 264 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4130  putative transcriptional regulator  49.78 
 
 		 265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2498  AraC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 245 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2063  AraC family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 311 aa  218  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47910  putative transcriptional regulator  51.16 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00926121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0885  AraC family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 290 aa  214  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1415  AraC family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 290 aa  214  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1891  AraC family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 294 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2199  AraC family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 290 aa  214  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0477  AraC family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 290 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.555067  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0574  AraC family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 290 aa  214  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.389496  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4602  AraC family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0287774  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1287  AraC family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4131  AraC family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2310  AraC family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1839  AraC family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  37.55 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2851  transcriptional regulator with PAS/PAC sensors, AraC family  40.18 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.595855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1157  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  29.65 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  37.29 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  41.24 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  39.78 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 319 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 319 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2310  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36 
 
 		 299 aa  75.1  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120361  normal  0.040249 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 307 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0694  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2813  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.57 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  40.78 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0723  AraC-like transcriptional regulator  34.45 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0910  helix-turn-helix, AraC type  33.65 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  28.93 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  35.58 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  33.62 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4971  transcriptional regulator, AraC family  36.79 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  hitchhiker  0.0000000000361988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0736  transcriptional regulator, AraC family  34.45 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 		 366 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  30.33 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3237  transcriptional regulator, AraC family  37.61 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.434177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0565  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3833  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.699646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  36 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3317  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1138  helix-turn-helix domain-containing protein  34.34 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1619  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.36 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 329 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 348 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>