More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1003 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 332 aa  689    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  72.94 
 
 		 348 aa  521  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  46.6 
 
 		 329 aa  326  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 324 aa  324  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 330 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  33.44 
 
 		 335 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  31.56 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  33.23 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  32.72 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  34.26 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 		 326 aa  195  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 334 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 306 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.01 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 347 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  32.72 
 
 		 347 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  32.72 
 
 		 347 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  30.15 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  31.02 
 
 		 360 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  29.6 
 
 		 324 aa  185  8e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  37.72 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 322 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.32 
 
 		 326 aa  182  8.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  32.15 
 
 		 347 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.33 
 
 		 327 aa  179  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  27.96 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.5 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.52 
 
 		 325 aa  169  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 331 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  28.7 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 335 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 337 aa  165  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 336 aa  165  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  35.08 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  29.76 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.48 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  29.36 
 
 		 337 aa  162  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  29.14 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 343 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 321 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.45 
 
 		 323 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  29.54 
 
 		 341 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  28.4 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3556  transcriptional regulator  33.69 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  28.09 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 314 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  29.14 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  28.98 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  32.23 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  29.97 
 
 		 319 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  27.13 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  27.5 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>