More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0910 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0910  helix-turn-helix, AraC type  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  37.39 
 
 		 231 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4042  helix-turn-helix domain-containing protein  39.33 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3309  AraC family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  33.6 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  32.52 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  32.53 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3653  helix-turn-helix domain-containing protein  28.09 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  29.71 
 
 		 250 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  29.46 
 
 		 250 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0773  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  25.74 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0330  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  28.23 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  27.42 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4999  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 279 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  24.59 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  36.7 
 
 		 320 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2851  transcriptional regulator with PAS/PAC sensors, AraC family  39.18 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.595855 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1506  helix-turn-helix domain-containing protein  23.89 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  32.41 
 
 		 328 aa  65.5  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  32.73 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  35.11 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  30.84 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  35.14 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  32.05 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  35.14 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  35.14 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  35.14 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  35.14 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  34.18 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  31.78 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2470  hypothetical protein  25.31 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  35.78 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  35.14 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  35.78 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  30.21 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0415  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0347  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3003  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2387  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0159935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 263 aa  62  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  35.51 
 
 		 324 aa  62  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  32.41 
 
 		 308 aa  62  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 333 aa  62  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2618  hypothetical protein  25.71 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  34.86 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  32.93 
 
 		 180 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  30.12 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4086  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3237  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  36.71 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  30.12 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  27.42 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3696  helix-turn-helix domain-containing protein  40.51 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1157  AraC family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1911  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  36.89 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  32.1 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  29.7 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  34.94 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  35.51 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1732  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3470  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 523 aa  58.9  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884533  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1223  transcriptional regulator, AraC family  24.8 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0726394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>