More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1757 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  27.08 
 
 		 311 aa  138  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  27.42 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  26.25 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  30.65 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  27.31 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  25.81 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  26.03 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  25.41 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  26.91 
 
 		 264 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  26.51 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  27.71 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  25.41 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  27.31 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 		 306 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  27.35 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 		 306 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  26.94 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1137  transcriptional regulator, AraC family  25.2 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  26.02 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0040  transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451948  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  23.58 
 
 		 276 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  22.73 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4939  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 286 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  24.18 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  24.8 
 
 		 286 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0066  AraC family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 290 aa  99.4  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  23.08 
 
 		 281 aa  99.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4421  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 286 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707997  hitchhiker  0.00308382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 279 aa  99  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  23.69 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2371  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0360277  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  26.53 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  23.79 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  28.69 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 303 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  25.63 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  25.63 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  24.51 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  38.53 
 
 		 366 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 277 aa  95.9  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  29.27 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  22.64 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  24.1 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  25.62 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 313 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  25.62 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 264 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 264 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  25.28 
 
 		 271 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 264 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>