More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1665 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 271 aa  556  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 308 aa  287  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  56.46 
 
 		 269 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3022  AraC family transcriptional regulator  56.04 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2657  AraC family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 273 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  52.4 
 
 		 266 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 271 aa  248  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  36.76 
 
 		 277 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  32.1 
 
 		 280 aa  159  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 273 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4086  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 281 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3237  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601996 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3705  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 281 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4183  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.806695 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 280 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1732  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4318  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103262  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2911  transcriptional regulator, AraC family  32.01 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2399  transcriptional regulator, AraC family  33.71 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1551  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 281 aa  128  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  33.58 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  32.46 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  33.21 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  33.19 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  32.48 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4141  helix-turn-helix domain-containing protein  25.27 
 
 		 278 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000207295  hitchhiker  0.0000292463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  33.85 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  34.63 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  31.34 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  29.09 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  30.45 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 290 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 290 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 278 aa  99  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  28.93 
 
 		 432 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 432 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 432 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 432 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 432 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  33.84 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  28.81 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 264 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 278 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 284 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  32.24 
 
 		 268 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0007  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1551  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0639275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1140  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 274 aa  89.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  29.32 
 
 		 283 aa  89.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>