More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4210 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
299 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  87.91 
 
 
306 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  86.6 
 
 
306 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  86.6 
 
 
306 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  84.28 
 
 
300 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  83.44 
 
 
303 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  83.89 
 
 
300 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  66.78 
 
 
276 aa  391  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  65.66 
 
 
276 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  59.83 
 
 
351 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  62.54 
 
 
275 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  38.23 
 
 
279 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  40.27 
 
 
284 aa  185  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 
284 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 
278 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  35.84 
 
 
276 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 
277 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  35.84 
 
 
281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  35.84 
 
 
281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.32 
 
 
277 aa  162  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  34.51 
 
 
278 aa  158  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  36.43 
 
 
283 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 
278 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  30.8 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  33.1 
 
 
275 aa  152  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
274 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 
264 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
312 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 
278 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  31.54 
 
 
275 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  29.27 
 
 
278 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
278 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
432 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
432 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
278 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
432 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
432 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
278 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  32.21 
 
 
432 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.72 
 
 
278 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  35.03 
 
 
279 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  32.42 
 
 
278 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  31.9 
 
 
278 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  31.62 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 
355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
280 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  32.27 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 
280 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
280 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 
267 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
277 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
275 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.3 
 
 
273 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 
280 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3613  transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 
278 aa  122  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
275 aa  122  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 
284 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  30 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  30.03 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2631  transcriptional regulator, AraC family  33.56 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 
276 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 
276 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
266 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  29.35 
 
 
277 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2317  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  31.9 
 
 
283 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4183  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 
282 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.806695 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3705  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1791  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  31.02 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 
269 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 
264 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3237  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 
281 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1137  transcriptional regulator, AraC family  29.2 
 
 
270 aa  112  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  26.55 
 
 
265 aa  112  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1262  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 
278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1732  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.682937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>