More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3705 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3705  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 282 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4183  AraC family transcriptional regulator  98.23 
 
 		 282 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.806695 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1732  AraC family transcriptional regulator  92.2 
 
 		 281 aa  527  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  91.07 
 
 		 281 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4086  AraC family transcriptional regulator  90.71 
 
 		 281 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3237  AraC family transcriptional regulator  90 
 
 		 281 aa  510  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601996 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4318  AraC family transcriptional regulator  89.71 
 
 		 272 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103262  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 280 aa  348  7e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  53.6 
 
 		 281 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 277 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  49.81 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  47.62 
 
 		 277 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 285 aa  245  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 273 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  46.52 
 
 		 260 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  44.73 
 
 		 282 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  44.73 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  34.34 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 273 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3022  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2657  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  36.8 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  32.33 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  32.33 
 
 		 271 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  31.6 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2911  transcriptional regulator, AraC family  27.47 
 
 		 277 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1551  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4141  helix-turn-helix domain-containing protein  27.21 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000207295  hitchhiker  0.0000292463 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  31.3 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 284 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 278 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 303 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 306 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2399  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  26.45 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0866  transcriptional regulator, AraC family  29.43 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 276 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 276 aa  102  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 274 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  26.86 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  27.86 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 270 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 280 aa  99.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 278 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  26.09 
 
 		 283 aa  99  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0650  transcriptional regulator, AraC family  29.32 
 
 		 251 aa  98.6  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 312 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  31.01 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  23.36 
 
 		 280 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 259 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  24.18 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 355 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>