More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2167 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2657  AraC family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 269 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3022  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 269 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  31.46 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 280 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 271 aa  138  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 282 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2911  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4141  helix-turn-helix domain-containing protein  31.13 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000207295  hitchhiker  0.0000292463 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  34.28 
 
 		 277 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 		 281 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2399  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 277 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1551  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  33.08 
 
 		 271 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  32.7 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1732  AraC family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3705  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3237  AraC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601996 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4183  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.806695 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4318  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 272 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103262  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4086  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  29.88 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  29.72 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 		 278 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 275 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  24.25 
 
 		 280 aa  95.5  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  29.32 
 
 		 268 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  33.47 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  30.4 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  28.93 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  30.62 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  33.47 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  29.88 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  26.38 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 273 aa  92.8  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 		 276 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1262  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 290 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 279 aa  92  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  28.96 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  30.71 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 276 aa  89.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  26.48 
 
 		 275 aa  89.4  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 312 aa  89.4  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 279 aa  89.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 276 aa  89  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 303 aa  89  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  26.19 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  31.38 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5531  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 279 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  30.07 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5781  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273852 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 282 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 279 aa  85.9  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 282 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 278 aa  85.5  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1657  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 275 aa  85.5  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2585  AraC family transcription regulator  26.4 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429451  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2449  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0312  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00105398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  31.62 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>