More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1551 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1551  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 281 aa  590  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2911  transcriptional regulator, AraC family  86.48 
 
 		 277 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2399  transcriptional regulator, AraC family  50.55 
 
 		 277 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  47.54 
 
 		 271 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  47 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4141  helix-turn-helix domain-containing protein  40.14 
 
 		 278 aa  211  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000207295  hitchhiker  0.0000292463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 269 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2657  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 273 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 266 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3022  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 285 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 271 aa  128  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  27.76 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 261 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 280 aa  122  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 266 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 273 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 273 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4183  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.806695 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4318  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103262  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1732  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3237  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601996 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3705  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4086  AraC family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  28.57 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  27.47 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  24.73 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  29.3 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  27.86 
 
 		 266 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 266 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0007  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 272 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 		 284 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 279 aa  92.4  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  29.48 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  25 
 
 		 273 aa  89.4  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  24.5 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 278 aa  89  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 275 aa  89.4  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 277 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  25.78 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0617  AraC family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 306 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  25.75 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0866  transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 266 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4288  transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.170174 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0040  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  25.45 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  26.62 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0650  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>