More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0043 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  544  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  52.4 
 
 		 271 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  53.18 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2657  AraC family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 269 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 269 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3022  AraC family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  36.94 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  37.59 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 272 aa  164  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 273 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  32.58 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  34.96 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  34.23 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4086  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1551  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  34.23 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1732  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 281 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3237  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601996 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3705  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4183  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.806695 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4318  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103262  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2911  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 277 aa  135  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4141  helix-turn-helix domain-containing protein  28.93 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000207295  hitchhiker  0.0000292463 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 285 aa  128  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2399  transcriptional regulator, AraC family  34.85 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  32.21 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 281 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 281 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 278 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  33.58 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  31.23 
 
 		 284 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 266 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  33.6 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  30.57 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  33.6 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  28.29 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  32.41 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0007  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  32.64 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 312 aa  99.8  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 281 aa  99.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 280 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 274 aa  98.6  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 275 aa  98.6  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  32.23 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 278 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  30.15 
 
 		 278 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  27.21 
 
 		 280 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1551  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 275 aa  96.3  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0639275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  29.1 
 
 		 277 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  27.27 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  28.24 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  27.14 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  25.09 
 
 		 257 aa  92.8  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 276 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>