More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3537 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 276 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 276 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  99.64 
 
 		 276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  89.74 
 
 		 273 aa  511  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  83.57 
 
 		 280 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  83.57 
 
 		 280 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  83.21 
 
 		 280 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  83.21 
 
 		 280 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  82.25 
 
 		 276 aa  476  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 278 aa  288  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  51.81 
 
 		 275 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 279 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1551  AraC/XylS family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 275 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0639275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  34.2 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  35.42 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 281 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 281 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  33.46 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  33.2 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  30.15 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 278 aa  131  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 		 274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 277 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  30.19 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  28.31 
 
 		 283 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 279 aa  125  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  29.63 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  30.86 
 
 		 278 aa  123  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  29.8 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  30.3 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 277 aa  118  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  27.72 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1791  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0617  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  28.89 
 
 		 432 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 432 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 432 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 432 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 432 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  27.06 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 285 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  29.28 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3613  transcriptional regulator, AraC family  29.96 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  28.84 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  28.35 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  29.02 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>