More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3844 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 
257 aa  527  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
278 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.25 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0040  transcriptional regulator, AraC family  29.34 
 
 
268 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451948  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.53 
 
 
278 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  28.73 
 
 
278 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 
278 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 
278 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 
279 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  27.14 
 
 
284 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 
278 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  30.23 
 
 
275 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3613  transcriptional regulator, AraC family  29.85 
 
 
278 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  29.32 
 
 
271 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 
284 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 
278 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 
278 aa  102  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 
285 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 
276 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 
278 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 
275 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 
275 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2657  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 
269 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  28.29 
 
 
275 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 
278 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  27.45 
 
 
279 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  23.6 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  27.34 
 
 
278 aa  99.8  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 
275 aa  99.4  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 
275 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 
273 aa  98.6  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 
278 aa  98.6  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  24.81 
 
 
275 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  25.58 
 
 
277 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  25.62 
 
 
278 aa  96.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  28.23 
 
 
286 aa  96.3  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 
266 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3022  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.41 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 
276 aa  94.4  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 
276 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  26.82 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  26.62 
 
 
269 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  26.77 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  23.72 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  21.96 
 
 
303 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  24.81 
 
 
281 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  25.09 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  24.81 
 
 
281 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 
271 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  23.99 
 
 
277 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  25.29 
 
 
264 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  25.29 
 
 
264 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  25.29 
 
 
264 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1791  transcriptional regulator, AraC family  25.58 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 
290 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 
290 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  25.48 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  26.82 
 
 
272 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  25.19 
 
 
432 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  25.51 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6455  transcriptional regulator, AraC family  24.46 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 
250 aa  89.4  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0007  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 
272 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 
432 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 
270 aa  89.4  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 
432 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 
432 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 
432 aa  89  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  25.1 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5781  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273852 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  27.09 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 
276 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  22.03 
 
 
300 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  22.03 
 
 
300 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  25.27 
 
 
280 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 
280 aa  87  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  26.02 
 
 
275 aa  86.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  25.59 
 
 
280 aa  86.3  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 
279 aa  85.9  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>