More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0091 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 278 aa  563  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  44.73 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 281 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 281 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 284 aa  214  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 277 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  44.78 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 276 aa  205  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  40.96 
 
 		 275 aa  205  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 278 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 312 aa  201  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  40.15 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  39.86 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  40.66 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 279 aa  198  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 303 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 276 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 278 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  37.83 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  38.24 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  39.92 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  37.87 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  33.82 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  35.87 
 
 		 284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  39.64 
 
 		 355 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 273 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  37.41 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  34.56 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3613  transcriptional regulator, AraC family  34.91 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  39.46 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 279 aa  158  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2317  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  32.73 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 273 aa  146  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 278 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 280 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  32.34 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  33.46 
 
 		 283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1791  transcriptional regulator, AraC family  34.8 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6122  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 280 aa  135  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  29.5 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 432 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 432 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  30.91 
 
 		 432 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 432 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 432 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 281 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  32.71 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  29.74 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  29.48 
 
 		 366 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 278 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  31.44 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>