More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3801 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 278 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3613  transcriptional regulator, AraC family  93.53 
 
 		 278 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  60.45 
 
 		 277 aa  363  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 278 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 279 aa  279  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  50.19 
 
 		 278 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 278 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  49.81 
 
 		 271 aa  271  6e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 277 aa  271  9e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  48.69 
 
 		 278 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  48.69 
 
 		 278 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 278 aa  268  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 278 aa  268  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  48.69 
 
 		 278 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 278 aa  267  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  45.52 
 
 		 275 aa  264  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  42.55 
 
 		 278 aa  263  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  46.27 
 
 		 275 aa  263  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  46.49 
 
 		 280 aa  262  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  44.89 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  39.03 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 279 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 284 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 277 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  33.83 
 
 		 276 aa  178  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 275 aa  178  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1791  transcriptional regulator, AraC family  37.69 
 
 		 277 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  35.27 
 
 		 355 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 		 278 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  33.85 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  33.2 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  31.64 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 306 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 266 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  32.79 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  32.79 
 
 		 275 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  29.69 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  29.62 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  28.63 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  33.88 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5781  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 280 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 279 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  30.04 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  28.73 
 
 		 257 aa  115  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5531  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  29.34 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  27.57 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 432 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0886  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 432 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 278 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 276 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  28.16 
 
 		 432 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>