More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6122 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6122  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
280 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  64.13 
 
 
283 aa  364  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 
278 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  34.46 
 
 
276 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 
279 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 
276 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  35 
 
 
278 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 
281 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 
281 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 
285 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 
278 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 
277 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 
278 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 
277 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 
300 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.66 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 
264 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 
300 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 
278 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 
278 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 
273 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.66 
 
 
277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  28.85 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 
312 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  33.2 
 
 
278 aa  125  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 
271 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 
285 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 
274 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 
279 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
306 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
306 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  29.62 
 
 
284 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  32.82 
 
 
284 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 
266 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
306 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 
284 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 
281 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 
303 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  29.13 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  25.67 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0066  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 
290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 
269 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  31.5 
 
 
288 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  28.63 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4421  AraC family transcriptional regulator  32.01 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707997  hitchhiker  0.00308382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
276 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4939  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 
286 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
276 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 
269 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  30.59 
 
 
281 aa  116  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  32.01 
 
 
275 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 
299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  28.36 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 
276 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 
285 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 
260 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 
355 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  32.51 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  32.69 
 
 
266 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 
283 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 
282 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 
277 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0886  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 
316 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1657  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 
284 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441347  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 
277 aa  108  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  28.1 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0312  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 
284 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00105398  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2585  AraC family transcription regulator  31.02 
 
 
284 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429451  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2449  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 
284 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
275 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 
282 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  31.64 
 
 
284 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 
282 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 
280 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
273 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
282 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 
268 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 
264 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 
268 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
290 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
290 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>