More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5582 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 272 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  34.35 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  30.48 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  31.42 
 
 		 278 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 279 aa  125  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  29.34 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 306 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 306 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  35.23 
 
 		 355 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 275 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 306 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  29.75 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2317  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  28.32 
 
 		 275 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 278 aa  112  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  31.54 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 308 aa  108  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  30 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  30.27 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  25.41 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  27.94 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  32.57 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  29.71 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  29.66 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5781  AraC family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4202  transcriptional regulator, AraC family  34.17 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0066  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6455  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4421  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707997  hitchhiker  0.00308382 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4939  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  27.14 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 		 277 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  29.1 
 
 		 275 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  25.99 
 
 		 277 aa  99.4  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 290 aa  99  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 290 aa  99  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 275 aa  99  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  28.73 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3237  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  28.84 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>