More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5781 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5781  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 267 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 266 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 276 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  33.6 
 
 		 273 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 312 aa  125  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  36.86 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  29.64 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 279 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  33.46 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  29.39 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 277 aa  119  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  34.98 
 
 		 284 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 284 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 278 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 278 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  29 
 
 		 275 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  34.5 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  32.32 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0066  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  26.94 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 274 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 264 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3613  transcriptional regulator, AraC family  32.47 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522508  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6122  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  28.63 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4318  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103262  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  32.22 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 		 281 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  31.58 
 
 		 432 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 432 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 432 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 432 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 432 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4183  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.806695 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4202  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1262  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6455  transcriptional regulator, AraC family  31.35 
 
 		 247 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3237  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 281 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  25.4 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4086  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  26.56 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0007  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0040  transcriptional regulator, AraC family  34.9 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451948  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  32.28 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1791  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  32.82 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  33.59 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 286 aa  99.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>