More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2887 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 264 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  57.59 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 277 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 277 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  44.14 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 278 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  43.08 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  38.19 
 
 		 275 aa  185  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 278 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  38.49 
 
 		 275 aa  185  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 278 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 277 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  38.34 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  35.83 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 278 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  39.68 
 
 		 276 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 275 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 312 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 274 aa  159  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 306 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  32.95 
 
 		 280 aa  155  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  42.45 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  33.85 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  37.15 
 
 		 281 aa  145  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  35.94 
 
 		 284 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  34.36 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3613  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522508  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 275 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 277 aa  135  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 267 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  35.43 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  35.63 
 
 		 278 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  33.97 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  34.12 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 278 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  33.2 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 279 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 274 aa  123  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 278 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6122  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  27.53 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 432 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 432 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 432 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  33.98 
 
 		 432 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 432 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  28.19 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  26.91 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2317  AraC family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1137  transcriptional regulator, AraC family  31.32 
 
 		 270 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  31.56 
 
 		 281 aa  118  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 		 288 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 297 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>