More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5279 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
285 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  99.3 
 
 
285 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  99.3 
 
 
285 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4421  AraC family transcriptional regulator  92.31 
 
 
286 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707997  hitchhiker  0.00308382 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4939  AraC family transcriptional regulator  91.26 
 
 
286 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  82.11 
 
 
300 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  51.82 
 
 
278 aa  271  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  49.82 
 
 
279 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  52.75 
 
 
276 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  49.08 
 
 
281 aa  262  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  51.25 
 
 
278 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  51.25 
 
 
278 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  48.72 
 
 
281 aa  258  9e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  51.46 
 
 
276 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  51.46 
 
 
276 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  50.73 
 
 
278 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  50 
 
 
281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0066  AraC family transcriptional regulator  47.77 
 
 
290 aa  225  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  37.59 
 
 
297 aa  148  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  37.15 
 
 
279 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  36.7 
 
 
271 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  29.01 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1137  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 
270 aa  135  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  32.68 
 
 
275 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  28.83 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  35.63 
 
 
284 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
276 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  30.12 
 
 
275 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  35.66 
 
 
300 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32450  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.469508 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  32.42 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  35.69 
 
 
303 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2449  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1657  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441347  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0312  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00105398  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2585  AraC family transcription regulator  33.2 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429451  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  35.77 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0886  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 
316 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 
284 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 
282 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 
282 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
278 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
278 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 
312 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.25 
 
 
277 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 
277 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
278 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 
273 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 
278 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 
271 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 
274 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0576  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 
284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 
278 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1262  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 
290 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 
278 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  32.88 
 
 
284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  30.04 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 
272 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2072  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
274 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2317  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
284 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 
432 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 
432 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 
432 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  39.55 
 
 
264 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 
432 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  33.83 
 
 
432 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.51 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  31.95 
 
 
284 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3671  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  39.54 
 
 
264 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  39.54 
 
 
264 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  39.54 
 
 
264 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  35.82 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6409  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 
258 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586073  normal  0.525784 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  36.3 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6122  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 
280 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  32.8 
 
 
270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0321  transcriptional regulator, AraC family  37.73 
 
 
264 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141392  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6121  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 
289 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  33.2 
 
 
266 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0621  AraC family transcriptional regulator  37.73 
 
 
278 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.378205  hitchhiker  0.00472777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
279 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  30.57 
 
 
268 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 
276 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>