More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6455 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6455  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2165  transcriptional regulator, AraC family  43.8 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4202  transcriptional regulator, AraC family  44.67 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 273 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 278 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  27.95 
 
 		 280 aa  98.6  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  33.46 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5781  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  29.08 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  30.2 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 266 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  31.73 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 279 aa  93.6  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 281 aa  93.2  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 284 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  27.42 
 
 		 277 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  29.32 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 281 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 273 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 275 aa  92.4  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 281 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 278 aa  92  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 274 aa  92  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1137  transcriptional regulator, AraC family  29.96 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 285 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0576  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  30.92 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  24.46 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 284 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 277 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  31.27 
 
 		 284 aa  89  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32450  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 271 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.469508 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 276 aa  88.6  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0733  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 275 aa  88.6  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.629568 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 275 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 282 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 282 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0973  transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  23.75 
 
 		 280 aa  86.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 283 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0886  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 316 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0312  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 284 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00105398  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1657  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 284 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441347  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  27.46 
 
 		 275 aa  85.9  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 276 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2585  AraC family transcription regulator  27.41 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429451  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2449  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 276 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4141  helix-turn-helix domain-containing protein  24.79 
 
 		 278 aa  85.5  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000207295  hitchhiker  0.0000292463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 276 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 282 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  43.4 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  29.88 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2631  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1262  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4288  transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.170174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1791  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5531  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  25.62 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1502  AraC family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 115 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.182478  normal  0.0194008 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1112  transcriptional regulator, AraC family  28.9 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0621  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.378205  hitchhiker  0.00472777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>