More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4288 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4288  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 273 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.170174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0617  AraC family transcriptional regulator  89.01 
 
 		 273 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 275 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  49.24 
 
 		 275 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  49.03 
 
 		 259 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0007  AraC family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0040  transcriptional regulator, AraC family  46.99 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 275 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  47.79 
 
 		 268 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  46.32 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 264 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 269 aa  211  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  45.25 
 
 		 274 aa  205  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0321  transcriptional regulator, AraC family  51.7 
 
 		 264 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141392  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2371  AraC family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0360277  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0901  AraC family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2143  AraC family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 266 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1126  AraC family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0931  AraC family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.846737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2007  AraC family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0228  AraC family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1568  AraC family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0287073  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1986  AraC family transcriptional regulator  51.48 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  43.51 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 278 aa  139  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 278 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  33.97 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  32.95 
 
 		 275 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  30.65 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  29.46 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 		 277 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  31.66 
 
 		 269 aa  125  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  25.19 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  32.57 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  30.71 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  30.71 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  31.92 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  30.4 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  31.66 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  34.8 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  33.07 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  27.55 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 		 273 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  29.1 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  28.29 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  32.09 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 300 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  28.35 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1137  transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  34.8 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>