More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3564 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  510  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  510  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  510  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0901  AraC family transcriptional regulator  95.06 
 
 		 264 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  91.67 
 
 		 264 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  90.53 
 
 		 264 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  86.31 
 
 		 264 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2371  AraC family transcriptional regulator  78.16 
 
 		 263 aa  359  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0360277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2143  AraC family transcriptional regulator  79.47 
 
 		 266 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2007  AraC family transcriptional regulator  79.47 
 
 		 266 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0228  AraC family transcriptional regulator  79.47 
 
 		 266 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1126  AraC family transcriptional regulator  79.47 
 
 		 266 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0931  AraC family transcriptional regulator  79.47 
 
 		 266 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.846737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1568  AraC family transcriptional regulator  79.47 
 
 		 266 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0287073  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1986  AraC family transcriptional regulator  79.09 
 
 		 266 aa  338  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0321  transcriptional regulator, AraC family  56.27 
 
 		 264 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141392  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  47.33 
 
 		 275 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  48.05 
 
 		 259 aa  214  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 266 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  44.76 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  45.97 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4288  transcriptional regulator, AraC family  52.47 
 
 		 273 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.170174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0617  AraC family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 273 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0040  transcriptional regulator, AraC family  45.67 
 
 		 268 aa  205  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451948  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 269 aa  195  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  43.2 
 
 		 274 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0007  AraC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  43.73 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  34.96 
 
 		 277 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 278 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 278 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 278 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 278 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  33.33 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  30.97 
 
 		 278 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  35.25 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  33.07 
 
 		 275 aa  135  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  38.17 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 285 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 285 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  44.4 
 
 		 355 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 285 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 312 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  30.62 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 278 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 280 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 270 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  33.57 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  37.45 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  35.39 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 276 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 276 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 276 aa  119  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 278 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4421  AraC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707997  hitchhiker  0.00308382 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4939  AraC family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  36.43 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  29.15 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  32.13 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  35.69 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  36.8 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6121  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 289 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  29.77 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>