More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2007 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2007  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
266 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1126  AraC family transcriptional regulator  99.25 
 
 
266 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2143  AraC family transcriptional regulator  99.62 
 
 
266 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1568  AraC family transcriptional regulator  99.25 
 
 
266 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0287073  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0228  AraC family transcriptional regulator  99.25 
 
 
266 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0931  AraC family transcriptional regulator  99.25 
 
 
266 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.846737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1986  AraC family transcriptional regulator  98.5 
 
 
266 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2371  AraC family transcriptional regulator  85.34 
 
 
263 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0360277  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  78.87 
 
 
264 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  79.47 
 
 
264 aa  380  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  79.47 
 
 
264 aa  380  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  79.47 
 
 
264 aa  380  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  78.33 
 
 
264 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  77.57 
 
 
264 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0901  AraC family transcriptional regulator  80 
 
 
264 aa  364  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0321  transcriptional regulator, AraC family  54.68 
 
 
264 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141392  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  50.18 
 
 
275 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  45.77 
 
 
268 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  45 
 
 
268 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  48.64 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0617  AraC family transcriptional regulator  51.3 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  48.29 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  49.41 
 
 
275 aa  212  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4288  transcriptional regulator, AraC family  51.85 
 
 
273 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.170174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  47.33 
 
 
266 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0040  transcriptional regulator, AraC family  46.51 
 
 
268 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451948  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  47.45 
 
 
274 aa  199  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  44.31 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0007  AraC family transcriptional regulator  48.44 
 
 
272 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  42.64 
 
 
286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 
278 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 
278 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  34.62 
 
 
275 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 
278 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 
271 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 
278 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 
278 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 
278 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 
278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  36.23 
 
 
277 aa  138  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.73 
 
 
278 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  30.26 
 
 
278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  32.82 
 
 
275 aa  135  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  35 
 
 
277 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  43.87 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 
312 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  28.74 
 
 
280 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 
273 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 
278 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  30.56 
 
 
283 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  34.89 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 
278 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
285 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
285 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 
285 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  36.06 
 
 
285 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  33.6 
 
 
284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  33.69 
 
 
306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  33.69 
 
 
306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  36.51 
 
 
264 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 
300 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 
273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  36.67 
 
 
311 aa  112  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 
300 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 
282 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 
281 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  37.4 
 
 
278 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  33.06 
 
 
278 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  35.89 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 
280 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  34.05 
 
 
306 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 
300 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 
280 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  35.86 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  34.66 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  30.31 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 
277 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  36.15 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 
281 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 
276 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 
281 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 
276 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  33.2 
 
 
288 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 
276 aa  108  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1137  transcriptional regulator, AraC family  33.61 
 
 
270 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  32.64 
 
 
272 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 
276 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>