More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4183 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
264 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  97.35 
 
 
264 aa  480  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  90.53 
 
 
264 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  90.53 
 
 
264 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  90.53 
 
 
264 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0901  AraC family transcriptional regulator  89.73 
 
 
264 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  84.41 
 
 
264 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2371  AraC family transcriptional regulator  76.54 
 
 
263 aa  345  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0360277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2143  AraC family transcriptional regulator  77.57 
 
 
266 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2007  AraC family transcriptional regulator  77.57 
 
 
266 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1126  AraC family transcriptional regulator  77.57 
 
 
266 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0228  AraC family transcriptional regulator  77.57 
 
 
266 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0931  AraC family transcriptional regulator  77.57 
 
 
266 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.846737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1568  AraC family transcriptional regulator  77.57 
 
 
266 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0287073  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1986  AraC family transcriptional regulator  77.19 
 
 
266 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0321  transcriptional regulator, AraC family  55.51 
 
 
264 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141392  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  49.8 
 
 
266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  49.22 
 
 
259 aa  221  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  48.47 
 
 
275 aa  221  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  45.72 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0040  transcriptional regulator, AraC family  47.06 
 
 
268 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  51.18 
 
 
275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0617  AraC family transcriptional regulator  50.78 
 
 
273 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4288  transcriptional regulator, AraC family  50.96 
 
 
273 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.170174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  45.97 
 
 
268 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  46.37 
 
 
268 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  45.49 
 
 
269 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  44 
 
 
274 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0007  AraC family transcriptional regulator  46.48 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  43.73 
 
 
286 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 
279 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 
277 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  34.38 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  32.22 
 
 
278 aa  145  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  35.36 
 
 
278 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 
278 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 
278 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 
278 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 
278 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  33.85 
 
 
275 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 
278 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 
278 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.9 
 
 
278 aa  142  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  35.5 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  36.08 
 
 
277 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  38.37 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  38.27 
 
 
284 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 
276 aa  135  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  39.26 
 
 
300 aa  135  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 
285 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  43.82 
 
 
355 aa  132  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 
280 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 
303 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
285 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  39.17 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  31.7 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  31.7 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  31.7 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 
279 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  34.9 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.92 
 
 
273 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  35.37 
 
 
278 aa  122  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 
278 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 
267 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  30.92 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4421  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707997  hitchhiker  0.00308382 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  33.07 
 
 
281 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4939  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
286 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  28.23 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
306 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  37.69 
 
 
288 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
306 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  33.45 
 
 
297 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 
280 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
306 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 
281 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  36.93 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  28.63 
 
 
280 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  36.74 
 
 
284 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 
272 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 
275 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 
275 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  36.02 
 
 
278 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  36.21 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 
303 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>