More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1986 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1986  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1126  AraC family transcriptional regulator  98.5 
 
 		 266 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2143  AraC family transcriptional regulator  98.87 
 
 		 266 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2007  AraC family transcriptional regulator  98.5 
 
 		 266 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0931  AraC family transcriptional regulator  98.5 
 
 		 266 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.846737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1568  AraC family transcriptional regulator  98.5 
 
 		 266 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0287073  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0228  AraC family transcriptional regulator  98.5 
 
 		 266 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2371  AraC family transcriptional regulator  84.96 
 
 		 263 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0360277  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  77.74 
 
 		 264 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  79.09 
 
 		 264 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  79.09 
 
 		 264 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  79.09 
 
 		 264 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  77.95 
 
 		 264 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  77.19 
 
 		 264 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0901  AraC family transcriptional regulator  80.23 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0321  transcriptional regulator, AraC family  54.68 
 
 		 264 aa  235  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141392  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  50.18 
 
 		 275 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  46.15 
 
 		 268 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  45.38 
 
 		 268 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0617  AraC family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4288  transcriptional regulator, AraC family  51.48 
 
 		 273 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.170174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 275 aa  211  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  47.53 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  47.86 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0040  transcriptional regulator, AraC family  46.12 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451948  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  47.06 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0007  AraC family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  42.25 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 278 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  34.36 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  34.59 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 278 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  36.12 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  30.77 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  32.43 
 
 		 275 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  43.48 
 
 		 355 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  28.74 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  30.56 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  33.6 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  32.44 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  31.08 
 
 		 269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  36.51 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  32.93 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  35.89 
 
 		 264 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  36.3 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  37.4 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  33.06 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  34.39 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  35.46 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0066  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4202  transcriptional regulator, AraC family  38.82 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>