More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4856 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  100 
 
 
271 aa  554  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  99.26 
 
 
271 aa  550  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2911  transcriptional regulator, AraC family  49.29 
 
 
277 aa  252  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1551  transcriptional regulator, AraC family  47.54 
 
 
281 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2399  transcriptional regulator, AraC family  42.4 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4141  helix-turn-helix domain-containing protein  39.35 
 
 
278 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000207295  hitchhiker  0.0000292463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 
277 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 
308 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  30.6 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2657  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
269 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 
273 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3022  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 
269 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 
285 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 
280 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1732  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
281 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4183  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 
282 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.806695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  33.21 
 
 
277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3705  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 
282 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4318  AraC family transcriptional regulator  32.96 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103262  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 
272 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  32.45 
 
 
281 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 
273 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3237  AraC family transcriptional regulator  32.96 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4086  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  33.21 
 
 
271 aa  125  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 
260 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 
282 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  30.57 
 
 
281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 
275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 
279 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  32.16 
 
 
269 aa  106  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 
266 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  26.12 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4288  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.170174 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 
280 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  26.79 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0617  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 
273 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  28.95 
 
 
286 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  25.62 
 
 
278 aa  93.6  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  26.72 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  26.72 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  29.04 
 
 
284 aa  93.2  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 
277 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  26.72 
 
 
276 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  24.81 
 
 
275 aa  92.4  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  31.77 
 
 
281 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  31.77 
 
 
281 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 
275 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  27.6 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  26.05 
 
 
276 aa  89.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0007  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 
272 aa  88.6  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  25.1 
 
 
257 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  25.7 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 
266 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 
284 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 
266 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  29.76 
 
 
264 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  28.06 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1112  transcriptional regulator, AraC family  28.32 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  29.26 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  26.12 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0040  transcriptional regulator, AraC family  28.23 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451948  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.97 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0650  transcriptional regulator, AraC family  28.19 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0866  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  24.81 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  25.5 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  24.18 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  24.2 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  28.41 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  24.72 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  24.18 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  24.24 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1551  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.13 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0639275  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>