More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0321 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0321  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 264 aa  524  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141392  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  56.27 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  56.27 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  56.27 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  55.89 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  55.51 
 
 		 264 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2371  AraC family transcriptional regulator  53.46 
 
 		 263 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0360277  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0901  AraC family transcriptional regulator  56.27 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2007  AraC family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2143  AraC family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0931  AraC family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.846737  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1126  AraC family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1986  AraC family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0228  AraC family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1568  AraC family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0287073  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4288  transcriptional regulator, AraC family  51.7 
 
 		 273 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.170174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  51.17 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0617  AraC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  51.39 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0007  AraC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 266 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  45.63 
 
 		 268 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  42.91 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0040  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 268 aa  185  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451948  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  42.54 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  40.88 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  36.33 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  33.98 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 285 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 285 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  31.42 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  35.54 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  35.27 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  36.58 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 278 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 277 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 278 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  35.54 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0066  AraC family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  28.69 
 
 		 277 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  42.91 
 
 		 355 aa  118  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  34.43 
 
 		 274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 276 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  30.15 
 
 		 281 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  36.19 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  29.89 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4421  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707997  hitchhiker  0.00308382 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4939  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  30.61 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  33.46 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 272 aa  108  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  29.12 
 
 		 280 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  29.05 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4202  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 247 aa  108  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 275 aa  108  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 280 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  34.56 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  32.79 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>