More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1502 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1502  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.182478  normal  0.0194008 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6083  transcriptional regulator, AraC family  93.64 
 
 		 142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.864918 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6584  AraC family transcriptional regulator  75.73 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0792  AraC family transcriptional regulator  58.24 
 
 		 163 aa  105  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.595246 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 131 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3070  helix-turn-helix domain-containing protein  45.1 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362329  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0046  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  44.23 
 
 		 318 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 270 aa  84.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6455  transcriptional regulator, AraC family  40.22 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 314 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  38.54 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  46.39 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 270 aa  78.2  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1112  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 296 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 278 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 278 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 277 aa  77.4  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  38.95 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  39.18 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 274 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  39.78 
 
 		 278 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 272 aa  73.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 272 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  41.05 
 
 		 303 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 313 aa  73.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 285 aa  73.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  38.54 
 
 		 336 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  35.48 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 278 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  39.78 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 277 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 266 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  41.76 
 
 		 291 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 285 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 305 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 305 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0973  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 260 aa  71.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 285 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 278 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 285 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 291 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 312 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 301 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  37 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  38.04 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  37.11 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  39.36 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  40.66 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  37.38 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  37.38 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0066  AraC family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2072  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 291 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 290 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  40.66 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  35.11 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0285  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000546061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1262  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 290 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 274 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 296 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  37.76 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  39.78 
 
 		 311 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3671  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 274 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 327 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  40.66 
 
 		 293 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>