More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0621 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0621  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 278 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.378205  hitchhiker  0.00472777 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1137  transcriptional regulator, AraC family  49.06 
 
 		 270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  51.5 
 
 		 270 aa  244  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1262  AraC family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  51.33 
 
 		 271 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  49.42 
 
 		 288 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  48.35 
 
 		 300 aa  228  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2072  AraC family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 274 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3671  AraC family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2024  AraC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 274 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32450  AraC family transcriptional regulator  51.87 
 
 		 271 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.469508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  48.65 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6409  AraC family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586073  normal  0.525784 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6121  AraC family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 289 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5531  AraC family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0886  AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 282 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 282 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2449  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0312  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 284 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00105398  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2585  AraC family transcription regulator  41 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429451  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1657  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 284 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441347  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0576  AraC family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0733  AraC family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.629568 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  40.54 
 
 		 281 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0066  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 278 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  36.03 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  36.82 
 
 		 297 aa  138  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  29.77 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2631  transcriptional regulator, AraC family  41.92 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  33.07 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 274 aa  125  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  28.41 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 281 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 285 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 281 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 306 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  33.6 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1791  transcriptional regulator, AraC family  29.96 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 275 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 277 aa  118  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  34.6 
 
 		 284 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4202  transcriptional regulator, AraC family  38.55 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  29.21 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4939  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4421  AraC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707997  hitchhiker  0.00308382 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  26.24 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  27.55 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  31.66 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 280 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  29.69 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  27.88 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 278 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 278 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  33.72 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 271 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>