More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0576 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0576  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
284 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0312  AraC family transcriptional regulator  90.85 
 
 
284 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00105398  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2449  AraC family transcriptional regulator  90.49 
 
 
284 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2585  AraC family transcription regulator  91.17 
 
 
284 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429451  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1657  AraC family transcriptional regulator  90.85 
 
 
284 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441347  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0886  AraC family transcriptional regulator  90.14 
 
 
316 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  90.49 
 
 
282 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  90.49 
 
 
282 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5531  AraC family transcriptional regulator  62.6 
 
 
264 aa  341  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  45.63 
 
 
271 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  46.06 
 
 
300 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  45.08 
 
 
270 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3671  AraC family transcriptional regulator  46.48 
 
 
274 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2072  AraC family transcriptional regulator  46.09 
 
 
274 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6409  AraC family transcriptional regulator  42.69 
 
 
258 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586073  normal  0.525784 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1262  AraC family transcriptional regulator  42.32 
 
 
290 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32450  AraC family transcriptional regulator  44.49 
 
 
271 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.469508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  43.56 
 
 
288 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2024  AraC family transcriptional regulator  44.31 
 
 
274 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6121  AraC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
289 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1137  transcriptional regulator, AraC family  43.5 
 
 
270 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  43.18 
 
 
303 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0733  AraC family transcriptional regulator  39.84 
 
 
275 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.629568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0621  AraC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
278 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.378205  hitchhiker  0.00472777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
278 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
278 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
278 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  33.07 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  27.27 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  28.41 
 
 
275 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  33.46 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 
285 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  28.93 
 
 
278 aa  125  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.03 
 
 
278 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0066  AraC family transcriptional regulator  31.64 
 
 
290 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 
281 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 
278 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 
279 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 
312 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2631  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 
282 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  28.46 
 
 
271 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  30.35 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  26.39 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 
278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 
278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 
276 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 
276 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 
276 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  30.59 
 
 
278 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  29.3 
 
 
297 aa  118  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  29.84 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 
285 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 
276 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.16 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 
276 aa  115  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  32.56 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 
281 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 
281 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 
275 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 
277 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 
273 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 
275 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 
277 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 
266 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  30.35 
 
 
269 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4421  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 
286 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707997  hitchhiker  0.00308382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 
284 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 
284 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 
290 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 
278 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4939  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 
286 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 
290 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  25.88 
 
 
278 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  28.31 
 
 
432 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 
432 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 
432 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 
432 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 
432 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  29.34 
 
 
283 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 
275 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  27.68 
 
 
283 aa  105  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 
264 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4202  transcriptional regulator, AraC family  33.06 
 
 
247 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3613  transcriptional regulator, AraC family  27.01 
 
 
278 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522508  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 
264 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>