More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0382 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  66.3 
 
 		 277 aa  362  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1791  transcriptional regulator, AraC family  66.91 
 
 		 277 aa  353  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  61.73 
 
 		 275 aa  351  8e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  37.92 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 275 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 281 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 281 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 279 aa  152  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 299 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 306 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 306 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  37.45 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 303 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 277 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  33.59 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 278 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 278 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 278 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  31.72 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  31.2 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1262  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 290 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  33.09 
 
 		 278 aa  135  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  32.56 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  35.43 
 
 		 303 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 277 aa  135  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  34.66 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  32.2 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  30.37 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1137  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  32.59 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  35.32 
 
 		 355 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32450  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.469508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  29.92 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  32.69 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 279 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3613  transcriptional regulator, AraC family  32.36 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522508  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  32.23 
 
 		 278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6409  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586073  normal  0.525784 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6121  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  30.98 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 266 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 432 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  28.42 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 432 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3671  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 432 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 432 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2072  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  29.52 
 
 		 270 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  29.35 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>