More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6117 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 297 aa  585  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2631  transcriptional regulator, AraC family  55.74 
 
 		 282 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 300 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  36.7 
 
 		 278 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 278 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  34.26 
 
 		 281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  38.93 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1137  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 278 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  34.98 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0066  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  31.69 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  30.25 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  36.23 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  36.26 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 281 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 281 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6121  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  29.54 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 273 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1262  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 277 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6409  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586073  normal  0.525784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  33.57 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5531  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 264 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2072  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4421  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707997  hitchhiker  0.00308382 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4939  AraC family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2585  AraC family transcription regulator  30.58 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0312  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00105398  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2449  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1657  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  28.72 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0886  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3671  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  33.69 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  31.41 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2024  AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 274 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0621  AraC family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.378205  hitchhiker  0.00472777 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  32.37 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0576  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 278 aa  116  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 275 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  31.08 
 
 		 432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  29.79 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4202  transcriptional regulator, AraC family  35.02 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  27.72 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>