More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4421 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4421  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 286 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707997  hitchhiker  0.00308382 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4939  AraC family transcriptional regulator  98.25 
 
 		 286 aa  564  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  93.01 
 
 		 285 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  93.01 
 
 		 285 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  92.31 
 
 		 285 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  83.57 
 
 		 300 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 279 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 276 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  51.99 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  51.99 
 
 		 278 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  48.55 
 
 		 281 aa  258  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 276 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 276 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  50 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0066  AraC family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 297 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  29.55 
 
 		 280 aa  138  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  35.32 
 
 		 271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 270 aa  132  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  36.15 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1137  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  31.52 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  36.29 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  35.98 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  28.78 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 276 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32450  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.469508 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1657  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2585  AraC family transcription regulator  32.3 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429451  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2449  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0312  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00105398  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0886  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 316 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1262  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  28.19 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  30.14 
 
 		 283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 284 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  33.96 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  29.26 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2072  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0576  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3671  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2317  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  28.91 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6122  AraC family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 276 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 355 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 432 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 		 432 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  26.2 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  32.16 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  32.33 
 
 		 268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2631  transcriptional regulator, AraC family  34.47 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  33.98 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>