More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6717 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 296 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  66.33 
 
 		 294 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  52.05 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  44.79 
 
 		 292 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3520  helix-turn-helix domain-containing protein  32.78 
 
 		 322 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  30.72 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1138  helix-turn-helix domain-containing protein  31.51 
 
 		 295 aa  148  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  33.11 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  30.82 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  42.45 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  38.69 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  43.4 
 
 		 133 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  43.56 
 
 		 112 aa  99  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 319 aa  99  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  31.06 
 
 		 287 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  35.54 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  37.27 
 
 		 180 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  33.97 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5154  helix-turn-helix domain-containing protein  44.86 
 
 		 120 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3201  AraC family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 182 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 316 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 305 aa  92.8  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 154 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 361 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 296 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 312 aa  92.4  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  33.92 
 
 		 306 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5244  AraC family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 134 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  30.05 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0816  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  29.87 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 196 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0228  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 123 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.654381 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1549  transcriptional regulator, AraC family  37.39 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0143415  hitchhiker  0.00302933 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 288 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 188 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  35.43 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3315  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 281 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.024617  hitchhiker  0.00000399067 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 285 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  30.88 
 
 		 301 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 430 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 322 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  35.76 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  42.57 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2387  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 209 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0159935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  28.62 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 327 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  35.03 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 318 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 202 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 282 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  32.84 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  32.84 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1857  helix-turn-helix domain-containing protein  38.26 
 
 		 126 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 306 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 295 aa  85.5  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 306 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 305 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 305 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 306 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  29.25 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  29.08 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1960  AraC family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 143 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  32.37 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>