More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0860 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 348 aa  720    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  72.94 
 
 		 332 aa  521  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  46.47 
 
 		 324 aa  315  9e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  43.66 
 
 		 329 aa  310  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  32.06 
 
 		 331 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  32.16 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 326 aa  185  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  30.06 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.08 
 
 		 327 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  29.12 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  29.12 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.1 
 
 		 326 aa  182  8.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 334 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.21 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  29.71 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  32.57 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  28.27 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  30.79 
 
 		 326 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  33.46 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  31.95 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.21 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  31.79 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  29.25 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  27.03 
 
 		 336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  33.82 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.73 
 
 		 323 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 299 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.83 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 347 aa  159  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  26.76 
 
 		 345 aa  155  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.54 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 329 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  28.15 
 
 		 337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 361 aa  146  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 322 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 372 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 330 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3556  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253425 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  26.71 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  26.71 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  26.71 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  26.71 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  26.71 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  26.71 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  26.84 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 343 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  29.89 
 
 		 344 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  30.42 
 
 		 344 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  25.96 
 
 		 361 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 338 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 348 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  29.55 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  27 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  28.15 
 
 		 341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  26.9 
 
 		 333 aa  135  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  27.62 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  28.98 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  28.17 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  28.76 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>