More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2573 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  100 
 
 		 345 aa  698    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  63.11 
 
 		 347 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 360 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  43.87 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  43.25 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  41.02 
 
 		 336 aa  276  5e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  39.76 
 
 		 361 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  34.14 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 324 aa  192  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 337 aa  186  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  31.6 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  27.83 
 
 		 324 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  31.55 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.15 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  40.97 
 
 		 331 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  38.5 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  40.79 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  37.74 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  37.13 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  30.7 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.44 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  30.63 
 
 		 320 aa  165  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 306 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  36.68 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.56 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  35.68 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  37.44 
 
 		 347 aa  159  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  35 
 
 		 331 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  31.14 
 
 		 330 aa  159  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  38.01 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 285 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  38.01 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 348 aa  155  8e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  35.68 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  36.86 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.51 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  33.77 
 
 		 320 aa  153  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  32.03 
 
 		 326 aa  152  7e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 323 aa  152  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  31.9 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 329 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.04 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  32.13 
 
 		 334 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  30.33 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  29.48 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  33.93 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 331 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 331 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 316 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 333 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 361 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  37.33 
 
 		 319 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  31.23 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  31.17 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  37.13 
 
 		 332 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 345 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.76 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 335 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 356 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>