More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5008 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 332 aa  687    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  98.66 
 
 		 299 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  78.48 
 
 		 335 aa  555  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  78.12 
 
 		 331 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  75.45 
 
 		 334 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  76.06 
 
 		 334 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  75.76 
 
 		 334 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  76.76 
 
 		 336 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  75.84 
 
 		 334 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  77.05 
 
 		 306 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 325 aa  205  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  37.05 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  36.31 
 
 		 331 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  32.81 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  36.14 
 
 		 361 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  30.12 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  36.24 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 348 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  31.99 
 
 		 331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  34.6 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.07 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  35.99 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.64 
 
 		 327 aa  159  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 332 aa  159  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.61 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.36 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 330 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 339 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.32 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  36.86 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 333 aa  149  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  28.44 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.27 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  29.72 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  30.45 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  32.34 
 
 		 344 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  28.88 
 
 		 347 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.68 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 347 aa  139  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  32.68 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  31.7 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  29.94 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3556  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  30.8 
 
 		 333 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  32.9 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  32.39 
 
 		 322 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2995  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  31.17 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 347 aa  129  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 		 327 aa  129  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 316 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  25.46 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  32.2 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 354 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 342 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29 
 
 		 338 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5693  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 		 336 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.86 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>