More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0622 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  100 
 
 		 340 aa  693    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  46.18 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  43.25 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  41.87 
 
 		 361 aa  268  7e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 336 aa  253  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  37.85 
 
 		 360 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  38.72 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  34.13 
 
 		 336 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  35.74 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  33.94 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 324 aa  186  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  32 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 326 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  34.24 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  32.09 
 
 		 337 aa  178  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.21 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  32.93 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 324 aa  176  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  34.76 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  34.45 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 330 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 343 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  31.9 
 
 		 326 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  35.45 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  32.42 
 
 		 331 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  37.55 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.47 
 
 		 325 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  29.45 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  31.61 
 
 		 347 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.72 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  31.32 
 
 		 347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  33.21 
 
 		 332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 347 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  29.18 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  32.76 
 
 		 320 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.8 
 
 		 327 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.87 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  35.37 
 
 		 326 aa  156  6e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  30.34 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  31.2 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  28.27 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  31.93 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 330 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.55 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 349 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 325 aa  145  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  32.75 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.72 
 
 		 330 aa  142  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  29.83 
 
 		 339 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  29.45 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  30.67 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  32.19 
 
 		 338 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  32.14 
 
 		 333 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  28.62 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>